肥厚型心肌病（HCM）是最常见的遗传性腹黑病欧洲杯2024官网，在好意思国每 200 至 500 东说念主中就有 1 东说念主患病。迄今阻抑的征询主要连系在发现与 HCM 谈论的基因序列变异，然汉典识别的基因序列变异与 HCM 的临床推崇之间仍存在广宽的剖释差距。此外，介导 HCM 发病机制以及疾病进展为严重病症的分子通路仍不解确。
2024年10月12日哥伦比亚大学欧文医学中心征询团队在JACC发表名为“Comprehensive Proteomic Profiling of Human Myocardium Reveals Signaling Pathways Dysregulated in Hypertrophic Cardiomyopathy”的著作，通过SomaScan 7k panel测量并取得了迄今阻抑对东说念主类肥厚型心肌病（HCM）心肌组织进行的最全面（检测逾越 7000 种卵白质）、界限最大（n=99 例 HCM 病例）的卵白质组学分析，从而详情在肥厚型心肌病（HCM）中存在互异转换的信号通路（图1）。
张开剩余82%图1.心肌卵白质组分析揭示HCM失调信号通路
01
征询样本
疾病组：HCM 患者的心室肌样本（n = 99）
对照组：腹黑功能平素的室断绝心肌样本（n = 15）
02
征询道路
卵白质组学分析
互异抒发卵白（DEP）已然 构建模子分析（基于卵白质组谱差别疾病情状） KEGG 通路分析转录组学分析
互异抒发基因（DEG）已然 KEGG 通路分析 与卵白质组学长入分析与严重 HCM 临床打算谈论的卵白质通路分析
03
征询服从
心肌组织互异卵白及通路分析服从
1721 种（24%）卵白质在肥厚型心肌病（HCM）患者与对照对象之间存在互异抒发，956 种卵白质抒发上调，765 种卵白质抒发下调（图 2）。当比较 HCM 患者与对照组时，脱落偏最小二乘判别分析（sPLS - DA）模子八成基于卵白质组图谱差别疾病情状（图 3）。与对照组比较，HCM 组患者中几种与Ras - MAPK谈论的卵白质（ A-Raf、MAPKAPK2、MAPK11）抒发上调。
图2.HCM患者组与对照组比较的互异抒发卵白
图3.心肌卵白质组图谱二维得分图
对互异抒发卵白（DEPs）进行KEGG通路分析后发现，有 64 条通路存在显耀失调（FDR<0.05），Ras - 丝裂原活化卵白激酶（Ras - MAPK）通路居首（FDR<0.0001）。Ras - MAPK 的落魄游通路，包括 PI3K - Akt、Rap1、ErbB 和 FoxO 信号通路，也皆出现了失调。此外，与对照组比较，肥厚型心肌病（HCM）患者体内的泛素介导的卵白水解通路（FDR = 0.002）、血管生成谈论通路（缺氧带领因子 [HIF] - 1、血管内皮助长因子 [VEGF] 通路）以及 Hippo 通路（FDR = 0.001）也存在失调。此外还识别出了一些已知与 HCM 谈论的通路失调，其中包括多种主要与氨基酸代谢谈论的代谢通路、免疫和炎症通路（如细胞因子 - 细胞因子受体互相作用），以及纤维化的通路，举例细胞外基质（ECM）和组织结构谈论通路（如 ECM - 受体互相作用通路，图4）。
图4.HCM互异转换卵白的通路分析
心肌组织互异基因及通路分析服从
征询者接下来开展了心肌转录组分析手脚对卵白质组服从的考据。服从表示有 30646 个抒发基因，其中 2776 个（9.1%）存在互异抒发。对互异抒发基因（DEGs）进行KEGG通路分析，服从表示有 80 条通路显耀失调（FDR< 0.05 ）。卵白质组和转录组共有 30 条通路出现显耀失调（图 5），包括 Ras - MAPK、HIF - 1、Hippo、代谢、免疫与炎症，以及与纤维化谈论的ECM通路的失调（图5）。
图5.转录组考据分析
HCM严重经由临床打算谈论卵白通路分析
通过对与 HCM 通盘 5 项严重经由临床打算谈论的卵白质进行通路分析（图6），详情 Ras - MAPK谈论通路存在失调，另外还发现已知与 HCM 谈论的通路（即免疫和炎症、代谢以及组织结构 / 纤维化谈论通路）也存在失调。泛素介导的卵白水解通路、血管生成通路（如HIF - 1、VEGF 通路）以及 Hippo 通路，也与一项或多项严重疾病临床打算谈论且存在失调。
图6.与HCM严重经由临床打算谈论卵白通路分析
04
回来
这项针对HCM患者与腹黑功能平素对照者的多中心病例对照征询中欧洲杯2024官网，通过SomaScan(7k)高通量卵白质组学平台对迄今数目最多的 HCM 患者（n = 99）进行了最为全面的心肌卵白质组分析。对互异抒发卵白（DEPs）的通路分析标明，HCM 患者心肌中的 Ras - MAPK及谈论通路存在失调，另外还发现与 HCM 谈论的其他新发现的通路（泛素介导的卵白水解通路、血管生成谈论通路以及 Hippo 通路），并阐述了已知通路（代谢、免疫与炎症以及纤维化谈论通路）也存在失调，对心肌转录组的分析考据了这些发现。临了通过对与 HCM 通盘 5 项严重经由临床打算谈论的卵白质进行通路分析进一步讲解了这些通路与 HCM 严重经由的临床打算谈论且存在失调，本征询服从有助于咱们贯通 HCM 的发病机制和进展，要是在改日征询中取得阐述，可能为有 HCM 风险或已患 HCM 的患者征战更多拯救战略。
发布于：四川省